近十年来，医院承担了国家及省部级科研项目1500余项，获科技成果奖近300项，包括国家科技进步一等奖1项、国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖3项、国家科技进步三等奖1项。获国家重点研发项目多项，医院重大原创科研成果亮相国家科技创新成就展，接受党和国家领导人的检阅。医院新冠疫情科技贡献排名全球医院第3，多篇原创科技论文发表在《自然》《细胞》《柳叶刀》《循环》《美国科学院院报》等世界顶级杂志上。中国卓越科技论文数位居全国第6，SCI论文数位居全国第15，心血管内科学科活跃度位居全球医院第4，统计源论文数位居全国医院第4。

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市医院

在2020年抗击新冠肺炎疫情中，医院倾注全部力量，投入4000张床位、5000多名医护，负责10条战线的抗疫工作，在首义院区、光谷院区、武昌方舱、武体方舱4大抗疫主战场共救治新冠肺炎患者5510人，为武汉保卫战、湖北保卫战的胜利做出了历史性贡献。在武汉保卫战取得决定性胜利后，医院又先后受命驰援黑龙江、吉林、北京、香港、河南、新疆、上海等地，打满抗疫“全战场”。2022年底面对新一轮疫情大考，医院倾注全力，果断全面开放5238张床位打造“超级医院”，坚决落实新冠患者“应收尽收、应治尽治”，获得各级党委政府和人民群众高度赞誉。

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免疫科

医院坚持面向人民生命健康的国家战略，以融合创新为引擎，积极与武汉大学等校内外科研院所合作，共建跨学科融合医学研究中心，先后成立全球首个医学遥感信息研究院，全国医院首个医工融合研究院、公共卫生研究院、分子医学研究院、医学人工智能研究院、医学与物理研究院，7位两院院士、70余位国家级人才进驻医院交叉融合创新平台，共同推进“医学+”多学科交叉创新体系建设，培养具有国际视野、前瞻思维、学科交叉创新意识的创新团队和创新人才，以高端人才技术的集合优势攻关迫切需要解决的临床难题，为“健康中国”建设注入科技新动能。

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呼吸内科

医院目前拥有国家临床重点专科2个（呼吸与危重症医学科、普通外科），广东省临床重点专科7个（普通外科、胸外科、重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、肾内科），拥有17个深圳市重点医学专科及多个支撑平台。2003年率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术。2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地。2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月获批“中国胸痛中心”医院。2015年10月获批人类辅助生殖中心。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。2023年1月成功获批认定为“广东省老年疾病临床医学研究中心”

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内分泌科

近年来，医院科研团队连续在国际顶级期刊《自然》《细胞》发表研究成果，揭示阿尔茨海默病主要病因、研发帕金森病早期精准诊断方法，开创湖北临床医口先河；在全球率先研发内镜质量改善人工智能监测系统“内镜精灵”，引发国际高度关注。

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口腔科

器官移植术后移植物缺血/再灌注损伤、各种类型的排斥反应、免疫抑制药物毒性损伤、感染以及疾病复发等并发症的诊断和鉴别诊

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