2015年起全面实施亚专科培养模式，已建立甲状腺乳腺疾病、淋巴造血系统疾病、胃肠消化系统疾病、女性生殖系统疾病、呼吸系统疾病、泌尿及男性生殖系统疾病、头颈部病理、中枢神经系统疾病、软组织肿瘤、皮肤病理、骨组织病理、细胞学、器官移植病理、分子病理等病理亚专科，其中乳腺疾病和感染疾病病理亚专科为中华医学会病理分会亚专科学组委员单位，脑胶质瘤和呼吸系统疾病亚专科为中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会亚专科委员单位。已形成了一个较为完善的病理形态—免疫组化—分子病理综合病理诊断平台，满足了临床个体化治疗。

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普通外科

百年来，作为早期共产党人创办的红色医院，医院始终传承红色基因，积极响应党的号召，始终把人民放在心中最高位置，书写了与人民同呼吸、共命运的动人篇章。医院始终坚持以高质量党建引领高质量发展，在全国医院率先建立起四级党组织架构，3000多名党员充分先锋模范作用，扎实推进世界一流医院建设。

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肝胆外科

儿科成立于1952年，有着辉煌而悠久的历史。几任儿科主任都是在儿科学界享有盛誉和广泛影响力的专家，其中周华康教授是首都儿科研究所的创始人之一，袁承文教授曾担任《中华儿科杂志》的副主编，儿科也曾获得北京市级的先进集体奖励。经过几代医学专家及全体医务人员的共同努力，儿科得到全面发展，2001年成为国家重点学科，尤其以血液、神经及新生儿专业为特色专业。儿科门急诊24小时开放，诊治16岁以下儿童及青少年。各专业均设有专家门诊，具体参阅专家布告栏。

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血液内科

2018年6月，医院获广东省政府遴选为全省首批高水平医院。医院在三级公立医院绩效考核中屡创佳绩，连续三年获评等级A+

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泌尿外科

医院现有职工2300余人，其中高级职称390余人，中级职称1100余人，博士、硕士研究生600余人，享受国务院政府特贴专家1人，黄河三角洲学者2人，省、市有突出贡献的中青年专家12人，黄河口医学领军人才及市卫生健康领军人才40余人。拥有省级临床重点专科建设单位2个，省医药卫生重点专业1个，市级临床重点专科7个，市医药卫生重点学科9个，市重点实验室2个。编制床位1719张，年门诊量133万人次，出院患者7万人次，手术2万台次。

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医院目前拥有国家临床重点专科2个（呼吸与危重症医学科、普通外科），广东省临床重点专科7个（普通外科、胸外科、重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、肾内科），拥有17个深圳市重点医学专科及多个支撑平台。2003年率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术。2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地。2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月获批“中国胸痛中心”医院。2015年10月获批人类辅助生殖中心。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。2023年1月成功获批认定为“广东省老年疾病临床医学研究中

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