医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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医院目前拥有国家临床重点专科2个（呼吸与危重症医学科、普通外科），广东省临床重点专科7个（普通外科、胸外科、重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、肾内科），拥有17个深圳市重点医学专科及多个支撑平台。2003年率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术。2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地。2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月获批“中国胸痛中心”医院。2015年10月获批人类辅助生殖中心。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。2023年1月成功获批认定为“广东省老年疾病临床医学研究中心”

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医院是滨州医学院附属医院、山东省新疆医学人才培训基地、东营市重点大学生实习实训基地。获省、市级科技进步奖140余项；获批省自然科研基金立项5项、省医药卫生科技发展计划项目立项30项；发表论文2000余篇，出版著作500余部；发明专利及授权实用新型专利600余项。

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医院拥有优越的研究平台和软硬件条件，设有国家重点实验室（临床病毒实验室）、国家中医药重点实验室（心电生理、消化病学、中药药剂）、国家药物临床试验机构（32个专业）、国家临床医学研究中心分中心（精神心理、放射与治疗、慢性肾病、眼耳鼻喉），组建了以国家大鼠基因工程资源中心、湖北省模式动物中心、临床分子诊断中心、分子影像研究中心、转化医学中心为代表的一大批顶尖临床科研机构，拥有质谱仪、高通量测序仪、共聚焦显微镜、流式细胞分析仪、透射电镜等多种大型先进的设备仪器。

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