医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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心胸外科

医院是湖北地区首家政府举办的公立医院、国家首批三级甲等医院、湖北省人民政府重点建设的窗口医院，获全国文明单位、全国精神文明建设先进单位、全国五一劳动奖状集体、全国抗击新冠肺炎疫情先进集体等多项荣

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急诊科

病理科始建于20世纪70年代，先后涌现出邢寿富、田家乐、彭善友、黎辉、王则胜等为代表的一系列知名病理专家，为病理科的发展做出了巨大贡献。病理科集病理学临床、教学、科研、社会服务于一体，本着“科有特色、人有专长、精益求精、敢为人先”的建科理念，经过多年的发展，在学科建设、人才培养、新技术应用、教学及科研等方面取得了较大发展。

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呼吸内科

落实立德树人。学院每年承担武汉大学医学专业800余名本科生（五年制、5+3一体化、八年制）、1200余名博士、硕士研究生及外国留学生的临床教学、1400余名住培医师、600多名进修医师的培养任务。医学生毕业赴哈佛大学、北京大学、北京协和医院等国际、国内一流高校，博士就业率近五年100%，主要就职于北京、上海等一线城市顶级三甲医院。

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护理科等

病理科年病理量13万余例，其中常规活体标本检查7万余例，术中快速冰冻病理学检查8000多例，院外疑难病理会诊4000多例，细胞病理学检查近5万例，医疗辐射能力覆盖全国32个省、市、自治区、直辖市。近年来，全面重塑临床服务能力，保证病理诊断准确规范及时：常规诊断报告准确率99.91%，术中快速诊断准确率98.09%，常规病理报告3个工作日内发出比例97.45%，均超过三甲医院标准。始终把质量控制工作作为科室的首要工作之一，近年来参加NordiQC、PQCC、CNAS、CCPI、CCP、湖北省病理科医疗质量控制中心等组织的相关室间质评，通过率100%，已获得国际级、国家级及省级质量控制认证88项。

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免疫科

医院现有三个院区（院本部、东院区、西院区）、五个门诊部（皖西西路门诊部、梅山南路门诊部、皖西东路门诊部、解放中路门诊部、西环路门诊部），总建筑面积36万平方米。内科DSA中心楼、六安市传染病医院、六安市肿瘤医院正在全面推进实施中。门急诊改扩建大楼于2022年9月3日投入使用。

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