2015年起全面实施亚专科培养模式，已建立甲状腺乳腺疾病、淋巴造血系统疾病、胃肠消化系统疾病、女性生殖系统疾病、呼吸系统疾病、泌尿及男性生殖系统疾病、头颈部病理、中枢神经系统疾病、软组织肿瘤、皮肤病理、骨组织病理、细胞学、器官移植病理、分子病理等病理亚专科，其中乳腺疾病和感染疾病病理亚专科为中华医学会病理分会亚专科学组委员单位，脑胶质瘤和呼吸系统疾病亚专科为中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会亚专科委员单位。已形成了一个较为完善的病理形态—免疫组化—分子病理综合病理诊断平台，满足了临床个体化治疗

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乳腺外科

百年来，作为早期共产党人创办的红色医院，医院始终传承红色基因，积极响应党的号召，始终把人民放在心中最高位置，书写了与人民同呼吸、共命运的动人篇章。医院始终坚持以高质量党建引领高质量发展，在全国医院率先建立起四级党组织架构，3000多名党员充分先锋模范作用，扎实推进世界一流医院建设。

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心胸外科

五届蝉联“全国文明单位”，省卫生系统唯一；三级公立医院绩效考核步入全国第一方阵A+，连续四年为我省第一；连续14年蝉联省群众满意医院；获评全国“公立医院党建示范医院”、“全国特色医院文化建设示范医院”；连续两年荣获全国“研究型医院”；六届蝉联中国公立医院最佳品牌传播榜二十强、全省卫生系统唯一，综合传播力居全省第一。先后被评为全国改善医疗服务十大亮点医院、全国百姓放心示范医院、全国医院后勤管理创新示范单位、中国医疗机构最佳雇主医院、人文爱心医院等；在全国抗击新冠肺炎疫情表彰大会上，被党中央、国务院、中央军委授予全国抗击新冠肺炎疫情先进集体、全国先进基层党组织。为引领全省卫生健康事业发展，服务健康中原建设大局作出了突出贡献

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心血管外科

实施院外疑难病理会诊与远程会诊、邮寄会诊相结合的多种会诊模式。对于行动不方便的就诊患者开通远程会诊服务，如需加做免疫组化/分子病理进一步确诊，则通过邮寄会诊协助解决，切实减轻患者就医负担。

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妇产科

在2020年抗击新冠肺炎疫情中，医院倾注全部力量，投入4000张床位、5000多名医护，负责10条战线的抗疫工作，在首义院区、光谷院区、武昌方舱、武体方舱4大抗疫主战场共救治新冠肺炎患者5510人，为武汉保卫战、湖北保卫战的胜利做出了历史性贡献。在武汉保卫战取得决定性胜利后，医院又先后受命驰援黑龙江、吉林、北京、香港、河南、新疆、上海等地，打满抗疫“全战场”。2022年底面对新一轮疫情大考，医院倾注全力，果断全面开放5238张床位打造“超级医院”，坚决落实新冠患者“应收尽收、应治尽治”，获得各级党委政府和人民群众高度赞誉。

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心血管内科

医院目前拥有国家临床重点专科2个（呼吸与危重症医学科、普通外科），广东省临床重点专科7个（普通外科、胸外科、重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、肾内科），拥有17个深圳市重点医学专科及多个支撑平台。2003年率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术。2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地。2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月获批“中国胸痛中心”医院。2015年10月获批人类辅助生殖中心。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。2023年1月成功获批认定为“广东省老年疾病临床医学研究中心”

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