医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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医院拥有博士后工作站1个，博士生培养点4个（骨科学、重症医学、泌尿外科、麻醉科），硕士生培养点31个；拥有“十二五”、“十三五”省级临床培育专科7个，省级临床特色专科4个；市级临床医学重点学科23个、重点建设学科5个。

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黑龙江省第三医院：心血管内科位于黑龙江省北安市交通路61号，靠近和平街、南京路、平安街和东繁荣街，联系电话为564⑤。

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病理科始建于20世纪70年代，先后涌现出邢寿富、田家乐、彭善友、黎辉、王则胜等为代表的一系列知名病理专家，为病理科的发展做出了巨大贡献。病理科集病理学临床、教学、科研、社会服务于一体，本着“科有特色、人有专长、精益求精、敢为人先”的建科理念，经过多年的发展，在学科建设、人才培养、新技术应用、教学及科研等方面取得了较大发展。

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学科带头人袁静萍主任为二级主任医师、硕士生导师、Humanitas University和Humanitas Research Hospital访问学者。武汉市中青年骨干人才、武汉市卫生局第二批百名优秀青年学科带头人、全国住院医师规范化培训优秀专业基地主任、武汉大学人民医院医疗名家、武汉大学人民医院医疗菁英。兼任中华医学会病理学分会第十二届委员会青年委员会委员、中华医学会病理学分会乳腺疾病学组（协作组）委员、中国医师协会病理科医师分会委员、中国抗癌协会肿瘤病理学专业委员会第一届肺癌病理学组委员、湖北省医学会病理学分会副主任委员、湖北省抗癌协会肿瘤病理专业委员会副主任委员、湖北省临床肿瘤学会肿瘤病理专家委员会候任主任委员、武汉市医学会病理学分会副主任委员、医疗卫生援黔专家团核心专家、《中华内分泌外科杂志》通讯编委、《中华病理学杂志》审稿专家、《中国组织化学与细胞化学杂志》副主编、《临床与实验病理学杂志》审稿专家、《The American Journal of Surgical Pathology（中文版）》编委、《肿瘤防治研究杂志》特约审稿专家。主持科研项目11项，以第一作者或通讯作者发表学术论文共140余篇，其中SCI论文31篇，总影响因子＞160，副主编、参编专著8部，授权专利3项。荣获湖北省科技进步三等奖1项（排名第一）、湖北省科技成果认定1项（排名第一）、湖南省科技进步二等奖1项（排名第三）、湖北省高等学校教学成果三等奖1项（排名第三）、湖南医学科技二等奖1项（排名第三）、武汉市科技进步奖三等奖1项（排名第二）、武汉大学教学成果二等奖1项（排名第一）。

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