医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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血液内科

医院是湖北地区首家政府举办的公立医院、国家首批三级甲等医院、湖北省人民政府重点建设的窗口医院，获全国文明单位、全国精神文明建设先进单位、全国五一劳动奖状集体、全国抗击新冠肺炎疫情先进集体等多项荣誉。

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检验科

医院入选“国家疑难病症诊治能力提升工程”“国家中西医协同旗舰医院”，是国家首批“外科基础技能提升项目基地医院”。心血管内科学为国家级重点学科，心血管内科、消化内科、肾病内科、神经内科、胸外科、神经外科、耳鼻咽喉-头颈外科、精神医学科、眼科、检验医学科、临床护理为国家临床重点专科。临床医学一级学科为湖北省重点学科，心血管疾病专科（心内科、心外科）、神经疾病专科（神经内科、神经外科）、眼科为武汉市建设国家医疗服务中心的国家或省级重点建设专科。

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儿科

医院以人体器官和系统为中心设置、以国家级重点学科和国家临床重点建设专科为核心，组建成立心血管医院、神经精神医院、眼耳鼻喉医院、消化医院、泌尿肾科医院等5大“院中院”。这一重大改革创新举措，不仅实现了“内外兼修”“强强联合”，更能以器官和系统为中心，向“精而强”的方向发展，向人民群众提供更加优质、高效、精准、便捷的“一站式”集成健康医疗服务，为集中医院优势学科打造特色学科群、打造国家及区域一流医疗中心奠定坚实基础。

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耳鼻喉科

在2020年抗击新冠肺炎疫情中，医院倾注全部力量，投入4000张床位、5000多名医护，负责10条战线的抗疫工作，在首义院区、光谷院区、武昌方舱、武体方舱4大抗疫主战场共救治新冠肺炎患者5510人，为武汉保卫战、湖北保卫战的胜利做出了历史性贡献。在武汉保卫战取得决定性胜利后，医院又先后受命驰援黑龙江、吉林、北京、香港、河南、新疆、上海等地，打满抗疫“全战场”。2022年底面对新一轮疫情大考，医院倾注全力，果断全面开放5238张床位打造“超级医院”，坚决落实新冠患者“应收尽收、应治尽治”，获得各级党委政府和人民群众

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呼吸内科

在湖北省内率先开展了乳腺癌新辅助治疗的RCB评分体系，能够更加全面及有效地评估乳腺癌新辅助治疗效果和患者预后，被认定为我院Ⅱ级新技术（国内领先），并获批省级项目1项。受邀在国内多个学术会议上交流推广，影响力辐射全国。

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