医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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近年来，医院坚持以人民健康为中心，确立了“建设国内一流、国际知名的高水平研究型医院和高质量国家区域医疗中心”的“双高”发展目标，在学科实力、科技创新、服务形象、品牌声誉等多个方面都迈上新的高度，实现了新突破。一院多区发展格局基本形成。阜外华中心血管病医院历经5年推动、2年9个月的辛勤筹建，顺利开诊投用，2019年纳入郑州大学附属医院体系，2020年成为首批国家区域医疗中心建设试点单位；北院区2023年12月10日正式开诊，服务和融入省委科技创新“三足鼎立”战略，立足中原农谷，着力打造豫北医疗高地；豫东南、豫西南、豫东、豫南、大别山、豫西分院挂牌运营；南院区项目正式开工；全面托管生殖妇产医院，探索构建全方位、全过程、全生命周期的女性健康服务模式；院本部省立眼科医院、生殖医院、脑血管病医院、中医院发展态势良好，河南省国际医疗中心品牌影响力不断提升，公共卫生医学中心、健康体检中心二部相继建成投用，河南省急救中心全新升级；全省首家获批“互联网医院”执业许可证；临床医学研究中心资源共享，开放共用，科研能力持续提升。站位学科前沿，调整学科结构，推动学科专业细化，学科实力明显增强；获批中西医协同“旗舰”医院建设试点项目，是省卫生系统唯一；移动卒中车、“慧思考”、Mazor，全省首台第四代达芬奇机器人、全省首台PET-MR、全国首家磁共振引导聚焦超声帕金森震颤治疗中心、国内首个一站式多模态影响卒中救治平台相继落户投用；先后通过电子病历系统功能应用分级评价五级医院、HIMSS（住院）六级测评、互联互通成熟度测评五级乙等；常态化开展人工心脏、心脏移植、双肺移植等标志性技术。率先建立空地互联网三位一体紧急救援体系，受到央视新闻联播关注报道；推行预住院、日间医疗、惠民医疗服务等一系列控费用、惠民生的医改举措，广受社会赞誉；构建以“尊重、慈爱、关怀、共情”为核心价值的改善患者体验服务体系，“我是省医人，我愿为您服务”深入人心，融入行动。以“七个省医”建设为抓手，注重文化传承，孕育发展文脉，塑造文化品牌；抓文明创建、促共建共享，软实力成为硬品牌。

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