医院目前拥有国家临床重点专科2个（呼吸与危重症医学科、普通外科），广东省临床重点专科7个（普通外科、胸外科、重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、肾内科），拥有17个深圳市重点医学专科及多个支撑平台。2003年率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术。2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地。2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月获批“中国胸痛中心”医院。2015年10月获批人类辅助生殖中心。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。2023年1月成功获批认定为“广东省老年疾病临床医学研究中心”

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心胸外科

在职职工7000余人，其中高级职称1000余名，包括中央“万人计划”、长江学者、国家杰青、国家优青、国家百千万人才工程人选国家有突出贡献的中青年专家、中央保健会诊专家、卫生部有突出贡献中青年专家、教育部新世纪优秀人才、湖北医学领军人才、武汉大学珞珈杰出学者等知名专家和一批饮誉海内外的名医。20余名诺贝尔奖得主和两院院士，受聘为医院客座、兼职教授。医院设立了院士工作站，多个院士团队与医院共创共建了交叉融合发展平台。

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肝胆外科

医院在职职工3000余人，高级职称527人；引进和培养硕士824、博士研究生46人。拥有江淮名医3人，二级教授2人，皖西名医35人；拥有安徽医科大学博士生导师5人：孙良业（骨科学）、邵松（骨科学），刘正东（重症医学科），李光远（泌尿外科），李仁虎（麻醉科）；硕士生导师97人。安徽医科大学、蚌埠医科大学、皖南医学院兼职教授52人。有60人余人在省级学会各专业委员会担任职务；市级专业委员会主任委员25人。

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外科

医院现有职工2300余人，其中高级职称390余人，中级职称1100余人，博士、硕士研究生600余人，享受国务院政府特贴专家1人，黄河三角洲学者2人，省、市有突出贡献的中青年专家12人，黄河口医学领军人才及市卫生健康领军人才40余人。拥有省级临床重点专科建设单位2个，省医药卫生重点专业1个，市级临床重点专科7个，市医药卫生重点学科9个，市重点实验室2个。编制床位1719张，年门诊量133万人次，出院患者7万人次，手术2万台次。

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儿科

2021年国自然立项31项，其中面上项目13项，青年基金项目18项，资助经费达1172万元，连续三年位居全市医疗卫生机构第一。2021年医院以第一作者或通讯作者共发表SCI学术论文总数426篇，其中中科院一区59篇，中科院二区159篇；以第一作者单位或通讯作者单位发表自然指数期刊9篇。2022年以我院为第一或通讯SCI论文共497篇，总影响因子3638；其中，中科院1区论文77篇，2区论文177篇，自然指数期刊4篇，在LANCET MICROBE，The Lancet. Infectious diseases，JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY，Molecular cancer等高水平期刊上发表数篇论文

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免疫科

用于泌尿系统肿瘤的早期发现以及膀胱癌术后的无痛性复发检测，已吸引20余家外院患者来我院检测。

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