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医院在微创诊疗、器官移植、生殖医学、心身医学、智慧医疗等领域贡献卓越，在医学史上创造了许多世界纪录、亚洲纪录和中国记录，心、肾、肺移植例数分别位居全国第4、2、7位。

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医院拥有3个广东省工程技术研究中心、4个研究所、6个深圳市医学重点实验室、5个深圳市工程技术研发中心，是国家级临床药物试验机构，干细胞临床研究机构，国家医疗器械试验机构。医院与广州呼吸健康研究院钟南山院士呼吸疾病团队等25家知名学科团队签订“三名工程”合作协

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器官移植术后移植物缺血/再灌注损伤、各种类型的排斥反应、免疫抑制药物毒性损伤、感染以及疾病复发等并发症的诊断和鉴别诊断。

医院在“国考”及四大全国医院排行榜中稳中有进，2022年最高位列全国第7位。2022年度中国医院/中国医学院校科技量值（STEM）”排行榜中，医院3大学科排名全国前10，科技产出排名全国医院第3名。2022年度《中国医院创新转化排行榜》上，医院荣获“全国进步最快榜单第1名”“专利授权量榜单第7名”“专利申请量榜单第8名”等多个全国前十奖项。