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近年来，医院先后开展和协作参与国家级、省部级科研课题项目10余项，校厅级科研项目60项，市级科研项目数61项，发表SCI论文40余篇，核心期刊200余篇。申报及中标国家自然科学基金、省自然科学基金、省教育基金、省中医药科研、省妇儿科研课题、省全科医学科科研课题等16项。每年有90多项新技术、新项目通过论证审核，年承担国家、省、市级继续教育项目80余项。

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医院是滨州医学院附属医院、山东省新疆医学人才培训基地、东营市重点大学生实习实训基地。获省、市级科技进步奖140余项；获批省自然科研基金立项5项、省医药卫生科技发展计划项目立项30项；发表论文2000余篇，出版著作500余部；发明专利及授权实用新型专利600余项。

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医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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医院在“国考”及四大全国医院排行榜中稳中有进，2022年最高位列全国第7位。2022年度中国医院/中国医学院校科技量值（STEM）”排行榜中，医院3大学科排名全国前10，科技产出排名全国医院第3名。2022年度《中国医院创新转化排行榜》上，医院荣获“全国进步最快榜单第1名”“专利授权量榜单第7名”“专利申请量榜单第8名”等多个全国前十奖项。

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实施院外疑难病理会诊与远程会诊、邮寄会诊相结合的多种会诊模式。对于行动不方便的就诊患者开通远程会诊服务，如需加做免疫组化/分子病理进一步确诊，则通过邮寄会诊协助解决，切实减轻患者就医负担。

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