医院以人体器官和系统为中心设置、以国家级重点学科和国家临床重点建设专科为核心，组建成立心血管医院、神经精神医院、眼耳鼻喉医院、消化医院、泌尿肾科医院等5大“院中院”。这一重大改革创新举措，不仅实现了“内外兼修”“强强联合”，更能以器官和系统为中心，向“精而强”的方向发展，向人民群众提供更加优质、高效、精准、便捷的“一站式”集成健康医疗服务，为集中医院优势学科打造特色学科群、打造国家及区域一流医疗中心奠定坚实基础。

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神经内科

医院遵循救死扶伤、全心全意为人民服务的宗旨，为保障人民群众健康做了大量工作，取得显著的成绩。医院组派医疗队完成急难险重任务，先后派员参加援外医疗队、援藏医疗队、援疆医疗队、抗洪抢险、抗震救灾医疗队等，完成防病、治病、救灾等项任务。

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康复科

医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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口腔科

医院为国家住院医师规范化培训基地及临床技能模拟培训中心。为暨南大学第二临床医学院博士后创新实践基地。医院呼吸与危重症医学科为国家首批专培基地。医院现有内科学、外科学、妇产科学、儿科学等24个教研室。已培养硕士生1160余名、博士生80余名，本科生450余名。每年招收临床实习生200余名，进修生200余名。

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呼吸内科

新时代、新征程。“十四五”期间，医院坚持以人民健康为中心，以建立健全现代医院管理制度为目标，努力把医院建设成为管理体制科学、管理制度健全、服务体系完备、学科技术突出、发展机制可持续的现代化三级甲等综合医院、全省一流市级区域医疗中心和高水平大学直属附属医院；积极构建“一院多区”新机制，按照“筑牢一个中心（院本部）、建设三大基地：西院区（特色诊疗中心与医养一体）、东院区（六安市肿瘤医院）、南院区（安徽医科大学大别山区域产学研中心暨六安市人民医院南院区项目）、打造六大平台（全市危急重症诊断治疗中心、医学生毕业后继续教育培训中心、区域影像诊断中心、区域医学检验中心、区域病理诊断中心、区域互联网+医疗技术综合应用中心）”的长远目标，深入推进公立医院改革,全面推进医院高质量发展

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体检科

医院在“国考”及四大全国医院排行榜中稳中有进，2022年最高位列全国第7位。2022年度中国医院/中国医学院校科技量值（STEM）”排行榜中，医院3大学科排名全国前10，科技产出排名全国医院第3名。2022年度《中国医院创新转化排行榜》上，医院荣获“全国进步最快榜单第1名”“专利授权量榜单第7名”“专利申请量榜单第8名”等多个全国前十奖项。

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