医院以人体器官和系统为中心设置、以国家级重点学科和国家临床重点建设专科为核心，组建成立心血管医院、神经精神医院、眼耳鼻喉医院、消化医院、泌尿肾科医院等5大“院中院”。这一重大改革创新举措，不仅实现了“内外兼修”“强强联合”，更能以器官和系统为中心，向“精而强”的方向发展，向人民群众提供更加优质、高效、精准、便捷的“一站式”集成健康医疗服务，为集中医院优势学科打造特色学科群、打造国家及区域一流医疗中心奠定坚实基

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体检科

本学科开展常规病理检查、术中冰冻切片快速病理检查、快速石蜡病理检查、细胞蜡块病理学检查、器官移植病理学检查、液基及脱落细胞病理学检查、免疫组织化学、特殊染色、原位杂交、荧光原位杂交（FISH）、远程会诊、邮寄会诊等

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内分泌科

医院拥有3个广东省工程技术研究中心、4个研究所、6个深圳市医学重点实验室、5个深圳市工程技术研发中心，是国家级临床药物试验机构，干细胞临床研究机构，国家医疗器械试验机构。医院与广州呼吸健康研究院钟南山院士呼吸疾病团队等25家知名学科团队签订“三名工程”合作协议。

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神经内科

百年来，作为早期共产党人创办的红色医院，医院始终传承红色基因，积极响应党的号召，始终把人民放在心中最高位置，书写了与人民同呼吸、共命运的动人篇章。医院始终坚持以高质量党建引领高质量发展，在全国医院率先建立起四级党组织架构，3000多名党员充分先锋模范作用，扎实推进世界一流医院建设。

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神经外科

医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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耳鼻喉科

病理科现为国家级住院医师规范化培训重点专业基地、湖北省临床重点专科、国务院学位委员会评定的硕士学位授予点、湖北省首家术中冰冻切片远程病理会诊中心、湖北省医学会病理学分会副主委单位、湖北省病理科医疗质控副主委单位、湖北省抗癌协会肿瘤病理专业委员会副主委单位、湖北省临床肿瘤学会肿瘤病理专家委员会候任主委单位、武汉市医学会病理学分会副主委单位。连续5年获得武汉大学人民医院“最佳文明科室”、连续2年获得武汉大学人民医院医疗服务“突出贡献科室”、曾获武汉大学人民医院“医疗质量优胜奖”1次、“医疗质量奖”2次。

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