医院以人体器官和系统为中心设置、以国家级重点学科和国家临床重点建设专科为核心，组建成立心血管医院、神经精神医院、眼耳鼻喉医院、消化医院、泌尿肾科医院等5大“院中院”。这一重大改革创新举措，不仅实现了“内外兼修”“强强联合”，更能以器官和系统为中心，向“精而强”的方向发展，向人民群众提供更加优质、高效、精准、便捷的“一站式”集成健康医疗服务，为集中医院优势学科打造特色学科群、打造国家及区域一流医疗中心奠定坚实基础。

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神经外科

学院获批国家“万人计划”教学名师，是首批国家临床教学培训示范中心、国家卫生专业技术资格考试试题开发基地，通过教育部临床医学专业国际认证，获评“全国党建工作样板支部”“全国最美大学生”“全国优秀全科专业住院医师规范化培训基地”等多项国家级荣誉。

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耳鼻喉科

医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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神经内科

医院现有临床、医技科室35个，开放病区76个，设置床位3000张；年门诊量200万人次，出院病人10万人次，手术4.5万例。医院拥有国内外大中型先进医疗设备百余台（套），引进PET-CT、引进3.0T超导核磁共振、GE-256排螺旋CT、医用直线加速器、高强度超声聚焦刀、氩氦刀等。

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安徽医科大学直属附属六安医院（六安市人民医院）始建于1949年8月，是一所集医疗、教学、科研、急救、预防、保健、康复于一体的全市唯一一家三级甲等综合性公立医院。医院五迁院址，十易院名；2000年4月，六安撤地建市，更改为现院名“六安市人民医院”，并沿用至今；2021年成为安徽医科大学附属六安医院，现为国家首批住院医师规范化培训基地、国家首批全科医生培训基地、国家临床药师培训基地、国家药物临床试验机构（GCP）、国家高级卒中中心、国家标准版胸痛中心，是皖南医学院护理教学基地（临床学院）、蚌埠医科大学临床学院、安徽省急诊急救、儿童重症监护、血液透析、伤口造口专科护士临床培训基地。

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