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医院拥有3个广东省工程技术研究中心、4个研究所、6个深圳市医学重点实验室、5个深圳市工程技术研发中心，是国家级临床药物试验机构，干细胞临床研究机构，国家医疗器械试验机构。医院与广州呼吸健康研究院钟南山院士呼吸疾病团队等25家知名学科团队签订“三名工程”合作协议。

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医院配备有大批高端医疗设备，包括德国西门子核磁共振、荷兰飞利浦超高端四维彩超、美国GE彩色多普勒超声仪、意大利数字减影血管造影机、DR数字照相系统、日本奥林巴斯高清晰电子胃肠镜、美国伟伦胆道镜、德国狼牌胸腔镜、日本全自动生化分析仪、美国雅培全自动化学发光分析仪、高档全套手术设备等，为患者提供准确、便捷的检查和治疗。

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2015年起全面实施亚专科培养模式，已建立甲状腺乳腺疾病、淋巴造血系统疾病、胃肠消化系统疾病、女性生殖系统疾病、呼吸系统疾病、泌尿及男性生殖系统疾病、头颈部病理、中枢神经系统疾病、软组织肿瘤、皮肤病理、骨组织病理、细胞学、器官移植病理、分子病理等病理亚专科，其中乳腺疾病和感染疾病病理亚专科为中华医学会病理分会亚专科学组委员单位，脑胶质瘤和呼吸系统疾病亚专科为中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会亚专科委员单位。已形成了一个较为完善的病理形态—免疫组化—分子病理综合病理诊断平台，满足了临床个体化治疗。

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2021年国自然立项31项，其中面上项目13项，青年基金项目18项，资助经费达1172万元，连续三年位居全市医疗卫生机构第一。2021年医院以第一作者或通讯作者共发表SCI学术论文总数426篇，其中中科院一区59篇，中科院二区159篇；以第一作者单位或通讯作者单位发表自然指数期刊9篇。2022年以我院为第一或通讯SCI论文共497篇，总影响因子3638；其中，中科院1区论文77篇，2区论文177篇，自然指数期刊4篇，在LANCET MICROBE，The Lancet. Infectious diseases，JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY，Molecular cancer等高水平期刊上发表数篇论文。

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