医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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心胸外科

在2020年抗击新冠肺炎疫情中，医院倾注全部力量，投入4000张床位、5000多名医护，负责10条战线的抗疫工作，在首义院区、光谷院区、武昌方舱、武体方舱4大抗疫主战场共救治新冠肺炎患者5510人，为武汉保卫战、湖北保卫战的胜利做出了历史性贡献。在武汉保卫战取得决定性胜利后，医院又先后受命驰援黑龙江、吉林、北京、香港、河南、新疆、上海等地，打满抗疫“全战场”。2022年底面对新一轮疫情大考，医院倾注全力，果断全面开放5238张床位打造“超级医院”，坚决落实新冠患者“应收尽收、应治尽治”，获得各级党委政府和人民群众高度赞誉。

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肝胆外科

本学科开展常规病理检查、术中冰冻切片快速病理检查、快速石蜡病理检查、细胞蜡块病理学检查、器官移植病理学检查、液基及脱落细胞病理学检查、免疫组织化学、特殊染色、原位杂交、荧光原位杂交（FISH）、远程会诊、邮寄会诊等业务。

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