医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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肝胆外科

2018年6月，医院获广东省政府遴选为全省首批高水平医院。医院在三级公立医院绩效考核中屡创佳绩，连续三年获评等级A+

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体检科

病理科现为国家级住院医师规范化培训重点专业基地、湖北省临床重点专科、国务院学位委员会评定的硕士学位授予点、湖北省首家术中冰冻切片远程病理会诊中心、湖北省医学会病理学分会副主委单位、湖北省病理科医疗质控副主委单位、湖北省抗癌协会肿瘤病理专业委员会副主委单位、湖北省临床肿瘤学会肿瘤病理专家委员会候任主委单位、武汉市医学会病理学分会副主委单位。连续5年获得武汉大学人民医院“最佳文明科室”、连续2年获得武汉大学人民医院医疗服务“突出贡献科室”、曾获武汉大学人民医院“医疗质量优胜奖”1次、“医疗质量奖”2次。

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泌尿外科

医院涌现出一大批在危急关头挺身而出、在关键时刻英勇施救的“见义勇为好医生、好护士、好职工、好医学生”，并组建“天使在身边”公益急救培训团队服务社会，形成一支弘扬正能量、彰显新风采的见义勇为英雄集体。他们坚持“人民至上、生命至上”，践行“一切为了人民健康”，在飞机、高铁、地铁等公共场所见义勇为30余次，相关事迹被人民日报等权威媒体报道300余次，阅读量超过20亿。团队获评包括全国优秀共产党员、全国五一巾帼标兵等在内的国家级荣誉6项。“人民医院、一院好人”的优秀文化享誉全国，让中国医护人员见义勇为成为了新时代社会风尚

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神经外科

病理科始建于20世纪70年代，先后涌现出邢寿富、田家乐、彭善友、黎辉、王则胜等为代表的一系列知名病理专家，为病理科的发展做出了巨大贡献。病理科集病理学临床、教学、科研、社会服务于一体，本着“科有特色、人有专长、精益求精、敢为人先”的建科理念，经过多年的发展，在学科建设、人才培养、新技术应用、教学及科研等方面取得了较大发展。

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耳鼻喉科

医院目前拥有国家临床重点专科2个（呼吸与危重症医学科、普通外科），广东省临床重点专科7个（普通外科、胸外科、重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、肾内科），拥有17个深圳市重点医学专科及多个支撑平台。2003年率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术。2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地。2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月获批“中国胸痛中心”医院。2015年10月获批人类辅助生殖中心。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。2023年1月成功获批认定为“广东省老年疾病临床医学研究中心”

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