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医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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医院有首义、光谷、洪山等多个院区，设置涵盖现代临床医学的各个临床医技科室127个，位居全国前列。医疗服务辐射到全国乃至海外，2021年医院门诊量580万，位居全国第8，开放病床5688张，位居全国第1

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医院把公益性鲜明地写在医院发展的旗帜上，全国首创“托管联合协作合作支援”等5种医联体模式，推动优质医疗资源扩容下沉和区域均衡布局。北到新疆，南到海南，医院紧密型医联体单位超过100家，专科联盟超1000个，每年有近千万患者从中受益。医联体建设成果，获得包括党和国家领导人和各级党委政府及基层群众广泛“点赞”。

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