医院拥有优越的研究平台和软硬件条件，设有国家重点实验室（临床病毒实验室）、国家中医药重点实验室（心电生理、消化病学、中药药剂）、国家药物临床试验机构（32个专业）、国家临床医学研究中心分中心（精神心理、放射与治疗、慢性肾病、眼耳鼻喉），组建了以国家大鼠基因工程资源中心、湖北省模式动物中心、临床分子诊断中心、分子影像研究中心、转化医学中心为代表的一大批顶尖临床科研机构，拥有质谱仪、高通量测序仪、共聚焦显微镜、流式细胞分析仪、透射电镜等多种大型先进的设备仪器。

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内分泌科

主院区（首义院区）位于武昌张之洞路，开放病床3880张，建有国际一流、功能完善的门诊和住院大楼，手术室均为净化层流到百级或千级标准，重症监护室、导管室等均设备先进、管理一流，PET/CT、PET/MRI、Revolution CT、大孔径静音MRI、IGRT肿瘤放疗直线加速器等国际先进医疗设备一应俱全。东院区（光谷院区）位于武汉东湖新技术开发区的“中国光谷”，按照高新科技化、人文化、山水园林化和国际化标准建设，开放病床1808张。洪山院区是湖北省重大疫情救治基地，着眼建设世界一流的综合医疗中心、以人为本的花园疗养胜地、面向未来的国际研究基地，设计病床1000张，将于2024年投入使用。

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消化内科

本学科开展常规病理检查、术中冰冻切片快速病理检查、快速石蜡病理检查、细胞蜡块病理学检查、器官移植病理学检查、液基及脱落细胞病理学检查、免疫组织化学、特殊染色、原位杂交、荧光原位杂交（FISH）、远程会诊、邮寄会诊等

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心胸外科

在职职工7000余人，其中高级职称1000余名，包括中央“万人计划”、长江学者、国家杰青、国家优青、国家百千万人才工程人选国家有突出贡献的中青年专家、中央保健会诊专家、卫生部有突出贡献中青年专家、教育部新世纪优秀人才、湖北医学领军人才、武汉大学珞珈杰出学者等知名专家和一批饮誉海内外的名医。20余名诺贝尔奖得主和两院院士，受聘为医院客座、兼职教授。医院设立了院士工作站，多个院士团队与医院共创共建了交叉融合发展平台

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消化内科

医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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外科

器官移植术后移植物缺血/再灌注损伤、各种类型的排斥反应、免疫抑制药物毒性损伤、感染以及疾病复发等并发症的诊断和鉴别诊断。

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