近年来，医院先后开展和协作参与国家级、省部级科研课题项目10余项，校厅级科研项目60项，市级科研项目数61项，发表SCI论文40余篇，核心期刊200余篇。申报及中标国家自然科学基金、省自然科学基金、省教育基金、省中医药科研、省妇儿科研课题、省全科医学科科研课题等16项。每年有90多项新技术、新项目通过论证审核，年承担国家、省、市级继续教育项目80余项。

重点发展Ⅳ类手术、介入手术、微创手术等。开展了腔镜甲状腺癌根治术、腹腔镜下肝叶切除术、椎间孔镜下腰椎间盘切除-椎管扩大成形-椎间植骨融合钉棒内固定术、单边双通道内镜（UBE）下腰椎间盘切除-椎管扩大成形-椎间植骨融合钉棒内固定术、微波消融技术在骨肿瘤手术中的应用、经导管主动脉瓣膜植入术、CT下肺部肿瘤微波消融术、荧光腔镜精准肺段切除术、FFR（血流储备分数）指导下的冠脉血运重建和冠脉介入治疗、介入治疗联合氩氦刀冷冻消融治疗在肝癌中的应用、腹腔镜下儿童腹部先天性肿瘤切除术等。

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医院设有包括心血管病、眼部疾病、消化疾病微创诊疗、生殖医学、精神疾病、肾结石等7个湖北省临床医学研究中心，以及抑郁症、临床腹膜透析、复杂食管疾病等3个武汉市临床医学研究中心。心血管病介入诊疗、肾病、消化内镜、超声、精神病、神经外科、眼科、变态反应、健康体检等多个湖北省质量控制中心设在医院。设有湖北省神经精神研究所、湖北省儿科研究所和武汉大学心血管病研究所、消化与肝病研究所、泌尿系病研究所、眼科研究所、耳鼻喉-头颈外科研究所、心脏自主神经研究中心以及生物医学工程、临床药学、妇科、生殖医学等研究室。湖北省免疫基础与临床应用国际科技合作基地和湖北省发改委模式动物工程研究中心设在医院，湖北省模式动物中心的技术水准与特色达国际一流。

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儿科成立于1952年，有着辉煌而悠久的历史。几任儿科主任都是在儿科学界享有盛誉和广泛影响力的专家，其中周华康教授是首都儿科研究所的创始人之一，袁承文教授曾担任《中华儿科杂志》的副主编，儿科也曾获得北京市级的先进集体奖励。经过几代医学专家及全体医务人员的共同努力，儿科得到全面发展，2001年成为国家重点学科，尤其以血液、神经及新生儿专业为特色专业。儿科门急诊24小时开放，诊治16岁以下儿童及青少年。各专业均设有专家门诊，具体参阅专家布告栏。

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