2015年起全面实施亚专科培养模式，已建立甲状腺乳腺疾病、淋巴造血系统疾病、胃肠消化系统疾病、女性生殖系统疾病、呼吸系统疾病、泌尿及男性生殖系统疾病、头颈部病理、中枢神经系统疾病、软组织肿瘤、皮肤病理、骨组织病理、细胞学、器官移植病理、分子病理等病理亚专科，其中乳腺疾病和感染疾病病理亚专科为中华医学会病理分会亚专科学组委员单位，脑胶质瘤和呼吸系统疾病亚专科为中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会亚专科委员单位。已形成了一个较为完善的病理形态—免疫组化—分子病理综合病理诊断平台，满足了临床个体化治疗。

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儿科成立于1952年，有着辉煌而悠久的历史。几任儿科主任都是在儿科学界享有盛誉和广泛影响力的专家，其中周华康教授是首都儿科研究所的创始人之一，袁承文教授曾担任《中华儿科杂志》的副主编，儿科也曾获得北京市级的先进集体奖励。经过几代医学专家及全体医务人员的共同努力，儿科得到全面发展，2001年成为国家重点学科，尤其以血液、神经及新生儿专业为特色专业。儿科门急诊24小时开放，诊治16岁以下儿童及青少年。各专业均设有专家门诊，具体参阅专家布告栏。

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医院拥有3个广东省工程技术研究中心、4个研究所、6个深圳市医学重点实验室、5个深圳市工程技术研发中心，是国家级临床药物试验机构，干细胞临床研究机构，国家医疗器械试验机构。医院与广州呼吸健康研究院钟南山院士呼吸疾病团队等25家知名学科团队签订“三名工程”合作协议。

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医院在职职工3000余人，高级职称527人；引进和培养硕士824、博士研究生46人。拥有江淮名医3人，二级教授2人，皖西名医35人；拥有安徽医科大学博士生导师5人：孙良业（骨科学）、邵松（骨科学），刘正东（重症医学科），李光远（泌尿外科），李仁虎（麻醉科）；硕士生导师97人。安徽医科大学、蚌埠医科大学、皖南医学院兼职教授52人。有60人余人在省级学会各专业委员会担任职务；市级专业委员会主任委员25人。

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医院为国家住院医师规范化培训基地及临床技能模拟培训中心。为暨南大学第二临床医学院博士后创新实践基地。医院呼吸与危重症医学科为国家首批专培基地。医院现有内科学、外科学、妇产科学、儿科学等24个教研室。已培养硕士生1160余名、博士生80余名，本科生450余名。每年招收临床实习生200余名，进修生200余名。

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医院与德国纽伦堡大学医学院、不莱梅港中心医院、英国伦敦大学、英国爱丁堡大学、加拿大西大略大学器官移植中心、美国休斯敦卫理公会医院、法国里尔大学医疗中心、韩国全南大学校病院、韩国大田宣医院、南非开普敦大学格鲁特舒尔医院建立起长期合作与交流平台，缔结友好医院。

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